Markt Nittendorf liegt im westlichen Landkreis von Regensburg und liegt am östlichen Ausläufer des Bayerischen Jura zwischen der Schwarzen Laber und der Naab.

Spannende Vielfalt der Vegetation ergibt sich durch Magerrasenflächen, bewirtschaftete Flächen und Ufergelände an der Schwarzen Laaber und der Naab.